Les graines et les huiles de lin et ainsi que les graines de chia sont autorisées dans le cadre du régime GAPS global. Les graines entières sont très fibreuses et ne doivent pas être consommées tant que la diarrhée n'a pas complètement disparu. Les personnes sujettes à la constipation trouvent utile de prendre une cuillère à café de ces graines chaque matin, après les avoir fait tremper dans de l'eau pendant une nuit (elles deviennent gélatineuses). Les huiles de ces graines doivent être pressées à froid. L'huile de lin est trop riche en acides gras oméga-3, c'est pourquoi je ne recommande pas de la consommer seule. Il est préférable de la prendre en mélange avec d'autres huiles pressées à froid, comme l'huile d'onagre ou l'huile de tournesol. L'huile de chia est nouvelle sur le marché ; elle semble avoir une composition d'acides gras plus équilibrée, et il peut donc être acceptable de la consommer seule. Toutefois, il est conseillé d'alterner les huiles dans votre régime alimentaire et de ne pas vous en tenir à une seule huile pendant de longues périodes, car toutes ces huiles ont leurs propres avantages et inconvénients. Il convient également de rappeler que la majeure partie des graisses du régime GAPS provient d'aliments d'origine animale ; ces huiles ne sont qu'un complément, pris dans un complexe avec des graisses animales, de l'huile d'olive et de l'huile de noix de coco.
