Tous les aliments naturels sont modifiés par la cuisson. C'est pourquoi de nombreux partisans préconisent de ne manger que des aliments crus, y compris des viandes et des poissons crus. Cependant, de nombreux aliments sont difficiles à digérer sous leur forme crue, en particulier pour une personne dont le système digestif est endommagé. De plus, manger uniquement des aliments crus n'est ni pratique ni acceptable pour la majorité des habitants de la planète. Certes, une partie de la structure des aliments sera altérée et endommagée au cours du processus de cuisson (y compris la production de graisses trans) mais tant que nous partons avec un aliment naturel non transformé et que nous le cuisinons à la maison, la plus grande partie de cet aliment reste parfaitement acceptable pour le corps. Les oléagineux et la farine d’oléagineux ne font pas exception : des dizaines de milliers de personnes ont guéri de maladies et se sentent bien en les consommant dans le cadre du protocole nutritionnel GAPS.